O Relatório de Atividades da Presidência Fiocruz apresenta o balanço das atividades desenvolvidas pela Fundação em determinado período.
O documento referente aos anos 2009-2011 está orientado em seis eixos estratégicos: Desafios do SUS; Ciência e Tecnologia, Saúde e Sociedade; Complexo Econômico-Industrial da Saúde; Saúde, Ambiente e Sustentabilidade; Saúde, Estado e Cooperação Internacional; Inovação na Gestão.
A Fiocruz estabeleceu, por meio de seu VI Congresso Interno, um conjunto de metas para o período 2009-2011, que expressam a projeção para as próximas décadas e o seu papel de instituição estratégica de Estado pertencente ao SUS. O relatório é resultado desse esforço.